Гиссарская крепость
Гиссарская крепость - не что иное, как дворец одного из беков Бухарского эмирата. Крепость со стенами толщиной 1 м , с бойницами для ружей и пушек возвышалась на склоне высокого холма и охранялась стражей. Внутри были бассейн и сад. Напротив крепости шумела базарная площадь с караван-сараем и множеством лавок.

К главному входу вели крупные лестницы и террасы, обложенные кирпичом. До наших дней они, к сожалению, не сохранились, как, впрочем, и все здание дворца. Единственное, что осталось от крепости – монументальные ворота из жженого кирпича с двумя цилиндрическими башнями, между которыми расположена стрельчатая арка, так строилось большинство ворот Бухары XVIII–XIX веков. Но даже этот фрагмент сегодня смотрится очень величественно и впечатляюще.
С Гиссарской крепостью связан ряд легенд, поддерживаемых местными жителями. По одной из них крепость построил Афросиаб для защиты от Рустама (прославленные герои произведения Фирдоуси «Шахнаме»).
Другая легенда гласит, что праведный халиф Али приехал в эти места на своём коне Дуль-дуль проповедовать ислам и остановился на горе, которая в наши дни носит название Пои-Дуль-дуль (к западу от Гиссара). Под видом акробата-канатоходца он пробрался с горы в крепость, но здесь был узнан и пленён. Но его верный конь принёс ему меч Зульфикара. С помощью этого меча он истребил всех врагов, в том числе и злого волшебника, который в то время владел крепостью.
Рядом с крепостью растут две огромные чинары, которым по 500–700 лет.

Старое и новое медресе
Старое медресе - Медресеи-кухна (XVI– XVII) – кирпичное сооружение с входом-порталом, увенчанное куполом. Входя внутрь, взору открывается широкий двор, который по периметру опоясывают худжры (кельи). Еще в начале XX века здесь обучались от 100 до 150 учащихся. Занятия прекратились лишь в 1921 году. Также в Старом медресе сохранилось помещение библиотеки.

Новое медресе - Медресеи-нав (XVII–XVIII), к сожалению, почти разрушено. От него сохранился только двухэтажный фасад. Оба медресе очень похожи на архитектурные постройки Самарканда и Бухары тех времен.

Караван-сарай (XVII–XVIII)
Ещё одно примечательное сооружение Гиссарского комплекса – караван-сарай «Хиштин» (в переводе - «Кирпичный»). На первый взгляд, это обычное сооружение. Чем же оно примечательно? Дело в том, что к XX веку караван-сарай представлял собой разрозненные остатки фундаментов и стен из жженого кирпича высотой не более одного метра. Первичный вид был запечатлен только на фото 1913 года. Детально изучив фотографию, реставраторы приступили к работам, результат которых можно сегодня увидеть воочию.

Мечеть Сангин
Еще один интересный памятник Гиссарского заповедника - купольная мечеть Сангин (XII–XVI), что в переводе означает «Каменная». Это связано с тем, что её стены мечети до половины выложены из камня. Уже в том веке строители проявили изобретательную смекалку, достойную наших дней. Под купол мечети они вмуровали четыре керамических кувшина без днища. Таким образом, получились оригинальные резонаторы, предназначенные для улучшения акустики помещения, где проводились моления и проповеди.

Мавзолей Махдуми Аъзама
Рядом со Старым медресе расположен мавзолей Махдуми Аъзама (XVI–XVII). Махдуми Аъзам в переводе означает «Величайший господин» и является не именем, а скорее титулом или прозвищем. Любопытно, что на территории Центральной Азии имеется несколько комплексов под этим названием, которые связывают с различными, реально существовавшими, людьми: государственными или религиозными деятелями. Кто похоронен в Гиссарском мавзолее, пока остается загадкой. Предположительно это Ходжа Мухаммед Хайвоки.